江苏省发改委于2016年批准，依托南京审计大学建设江苏省审计大数据工程实验室，主管单位是江苏省审计厅，是南京审计大学第一个获批的江苏省工程实验室，2021年通过考核转为江苏省审计大数据工程研究中心。目前工程研究中心聚焦“大数据审计、数智审计”工程化应用研究，依托信息技术发展，致力于审计领域科技创新。
工程研究中心组建了大模型人工智能审计应用、大数据审计工程化实施等研究方向团队，拥有专职研究人员21人，其中在编研究人员9人，客座研究人员12人，其中包含国家千人计划人才1名、教授3名、博士生导师2名、硕士生导师9人，科研实力雄厚。
近三年，工程研究中心作为主要参与单位和参与人编制发布GB/T 42584-2023“信息化项目综合绩效评估规范”；T/CITIF001-2024“数据合规审计指南”等多项国家标准，获发明专利3项，在核心期刊上发表论文50余篇，其中被SCI等收录30余篇。工程研究中心成员主持科研项目20项，其中国家基金项目3项，科研经费800万元；为国家审计机关、国央企提供大数据审计技术服务，经费超过500万元，成果显著。