金融风险管理研究中心于2010年8月由江苏省教育厅批准成立为江苏高校哲学社会科学重点研究基地。依托南京审计大学金融学、统计学、计算机科学、经济学等学科，基地遵循经济金融发展的客观规律，保持和发扬自身优势，形成了一个能够按照经济金融规律开展高水平研究的科研基地，培育了一批科研领军人物和相对稳定的高水平的金融风险管理的专门人才，取得了一批对金融风险管理有重要影响力的重大成果。依托中国人民银行和审计署的行业背景，本基地成员承担了大量中国人民银行及审计署的科研项目，在公司金融风险与内部治理、金融风险监测与控制、金融审计与风险管理、开放金融风险与经济发展等方向深入地开展了相应研究。
基地组建了公司金融风险与内部控制、金融风险监测与控制、金融审计与风险管理、开放金融风险与经济发展四个方向团队，团队成员30人；高级职称10人、具有博士学位教师28人，博士生导师3人，硕士生导师20余人，汇聚了享受国务院特殊津贴专家、江苏省教学名师、江苏省“333高层次人才”、江苏省有突出贡献的中青年专家、江苏省六大人才高峰高层次人才、江苏省高校“青蓝工程”优秀青年骨干教师等国家级、省级人才10余人，科研实力雄厚。
近三年，基地成员在《管理世界》《财贸经济》《Discrete Mathematics》等国内外顶尖刊物上发表论文100余篇，其中被SSCI、SCI等收录30余篇。基地成员主持科研项目40余项，其中国家基金项目10项，省部级课题4项，纵向科研经费300余万元；为地方经济社会服务项目10余项，经费超过400万元。获省部级以上科学研究成果奖2项。实验室成立以来举办全国性学术交流会议3次，教师参加国内外学术交流20余人次。