公共工程审计省高校重点实验室于2010年经江苏省教育厅批准成立，2024年1月根据江苏省教育厅要求，进行了优化重组。实验室紧密围绕国家和江苏省重大战略需求，致力于解决公共工程审计领域的共性关键科技问题，聚焦新基建工程审计、重大复杂工程审计、一带一路工程审计和工程审计数字化等方向，形成了以跨学科研究、数字化审计技术和产学研结合为特色的科研优势，为国家和地方经济发展提供有力支持。在新基建工程审计方面，实验室致力于确保项目的合规、经济和效率；在重大复杂工程审计方面，聚焦复杂工程审计技术与方法研究，防范重大复杂工程风险，提高建设效益；在一带一路工程审计方面，关注战略实施过程中的审计方法和技术；在工程审计数字化方面，充分利用信息技术手段，提高审计工作的效率和质量。
近三年，实验室承担了10余项国家级课题，承担了南水北调集团等大型央企等审计信息化建设等研究型课题；在国内外知名学术期刊发表了高水平论文60余篇，获教育部人文社科优秀成果一等奖。为政府和企事业单位提供审计技术方法、内部审计管理规范与创新、优秀审计项目实施策略、工程审计平台规划设计等方面的解决方案，在推动公共工程审计领域的科技进步和社会发展做出了重要贡献。